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基因科技提升产业竞争力

16S/18S/ITS扩增子/宏基因组测序


16S/18S/ITS扩增子测序

16S/18S rDNA分别是编码原核/真核细胞核糖体小亚基的DNA序列,而真菌18S、5.8S和28S rDNA基因间隔序列称为ITS。这些序列中既具有保守区也具有高变区,高变区具有属或种的特异性,是微生物系统发育和分类鉴定的推荐指标。


环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物的16S rDNA 、18S rDNA或ITS高变区的PCR扩增产物进行高通量测序并分析该环境下微生物群落的多样性及特征,因此微生物扩增子测序又被称为微生物多样性测序。


技术路线

16S 18S ITS扩增子-技术路线-阅微基因

服务优势
简单易做更高效:与传统研究方法相比,除具有通量大、产出数据多等优点,更能完全摆脱繁杂的菌种分离工作,物美价廉。
经验丰富:对各种环境或杂难样本有丰富的核酸提取经验,处理过包括粪便、土壤、水体、淤泥、空气、组织和物体表面等多种样本。
准确性高:基于具有物种特异性的高变区分析,真实反映菌群组成与结构。
分析内容多样:对测序结果进行多种分析方法展示,支持不同领域数据发表的要求。
项目定制讨论:中科院专家全程参与项目过程,数据分析更专业具体,可根据项目要求合理制定实验及分析流程,提供完善的结果。

测序策略
16S18SITS扩增子测序-测序策略

收样要求
16S 18S ITS扩增子-收样要求-阅微基因

生信分析流程
16S/18S/ITS扩增子测序-生信分析流程-阅微基因


宏基因组测序

宏基因组学(Metagenomics),又被称为微生物环境基因组学、元基因组学。其研究不要求对每种微生物进行分离、纯化和培养,而是以特定生物环境中总的微生物群落作为研究对象,提取全部DNA 对其进行高通量测序、序列组装和基因注释,获得环境微生物基因信息的总和。以此可以分析微生物群体基因组成多样性与丰度、微生物的群落结构、物种分类、进化关系、微生物与宿主间的互作关系,和发掘新的或具备特定功能的基因等。宏基因组测序与传统的研究方法相比,具有实验周期短、通量高、速度快、信息全等优势,极大地扩展了微生物学的研究范围。


技术路线
宏基因组测序-技术路线-阅微基因

服务优势
通量高:高通量测序平台,有助于发现特异物种信息,确保检测到样品中的低丰度微生物。
定制化服务:根据客户实际需求,定制个性化的测序及分析方案,助您得到最有效的结果
项目经验丰富:成熟的实验技术与团队,超百例项目的高质量完成
前沿分析手段:基于中科院微生物研究所最前沿的宏基因组分析策略,提供准确、完善的生信分析结果。

测序策略


收样要求
宏基因组测序-收样要求-阅微基因

生信分析流程
宏基因组测序-生信分析流程-阅微基因


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