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病毒基因组测序


背景信息

病毒(virus)由一种核酸分子(DNA或RNA)与蛋白质(protein)构成或仅由蛋白质构成。根据遗传物质的组成,可分为单链/双链 DNA 病毒、单链/双链 RNA 病毒、和蛋白质病毒(如朊病毒)。


在病毒研究和相关生产当中,传统的Sanger测序方法只能够对已知序列病毒的特定序列进行扩增测序,而病毒基因组测序可基于高通量测序技术平台上对病毒全基因组进行测序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因组序列,解析编码信息,并获得相应的变异信息。

病毒基因组测序在科研中的病毒溯源、鉴定、进化分析,工业生产中的病毒载体和毒株序列获取、病毒种子批的遗传稳定性和目的基因表达稳定性评估、疫苗用病毒基因组序列测序中都有非常广泛的应用场景。


技术路线

服务优势

应用广泛:该技术同时适用于单链/双链DNA病毒和单链/双链RNA病毒。

全基因组测序:较于病毒片段定向扩增后的Sanger测序,高通量测序不依赖于引物设计,不需要序列完全已知;可得到病毒全基因组的序列信息。

去除宿主污染:在不断精进的实验操作和分析流程之下,可最大程度的去除宿主基因,获得病毒99%的基因序列。

服务经验丰富:已处理过数十种,数百例感染过人类、动物、植物的病毒和噬菌体,拥有非常丰富的经验。


测序策略


收样要求


分析流程

病毒基因组测序-分析流程

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