热门搜索
SMA 非整倍体 细胞STR鉴定 男性家族排查 脆性X 叶酸 SNP Y-STR试剂 亲缘鉴定 DNA甲基化 16S/18S/ITS 采保试剂 微卫星不稳定 荧光定量PCR 宏基因组测序 核酸提取

工业与应用

基因科技提升产业竞争力

转录组(mRNA/lncRNA/miRNA/circRNA)测序

转录组mRNA测序

转录组(transcriptome)在广义上是指细胞内全部转录产物的集合,狭义上是指细胞中所有转录本(mRNA)的集合。转录组测序通常来说是指依托于高通量测序平台对细胞中的mRNAs进行测序。经过信息的整理和分析,可在不同的样本中挖掘具有意义的差异表达基因,研究可变剪切,融合基因事件和在转录水平上进行性状定位等。转录组测序现已广泛的应用到科研基础研究,临床疾病研究和药物研发等领域。常规转录组测序根据实验样品的不同可分为真核生物转录组测序和原核生物转录组测序;根据测序物种有无参考基因组可以分为有参基因组转录组测序和无参基因组转录组测序。

技术路线
转录组测序-技术路线-阅微基因

技术优势
任意物种检测:不依赖参考基因组,对与有无参考基因组的物种都可以进行转录组测序和后续的生物信息学分析
检测范围广:无需事先了解物种基因信息,可直接对任意物种进行转录组测序。可同时鉴定已知的、稀有低丰度的和新的转录本。
成熟的信息分析:测序数据可以用来分析基因表达差异,进行基因功能富集以及鉴定新转录本信息等。
高分辨率:测序结果精确到单碱基,可以检测到由可变剪切造成的单个碱基差异。

测序策略
转录组测序-测序策略-阅微基因

收样要求
转录组测序-收样要求-阅微基因

生信分析流程

转录组测序-生信分析流程(有参)-阅微基因

有参转录组测序生信分析流程



转录组测序-生信分析流程(无参)-阅微基因
无参转录组测序生信分析流程

长链非编码RNA(lncRNA)测序


长链非编码RNA(Long non-coding RNAs, lncRNA)是一类长度超过200 nt 且少有或不具有蛋白质编码潜能的复杂RNA,以带有polyA 尾和不带有polyA 尾两种形式广泛的存在于各类生物体内。LncRNA 可以与DNA,RNA 或蛋白质结合,在表观修饰上,转录过程前后等多种水平调控基因的表达,并具有跨物种的低保守性、组织特异性和丰度低等特点。近年来对于lncRNA 的研究广泛涉及了人类疾病,农业生产和基础研究等,但仍有绝大部分的lncRNA 与其功能尚不清晰。lncRNA 测序采用去除rRNA 的方法进行建库,利用高通量测序技术并依托强大的生物信息分析平台,对于样品内全部已知或未知的lncRNAs 进行全面、深入的研究,揭示其在疾病或特定生物学过程中的功能。

技术路线
长链非编码RNA(lncRNA)测序-技术路线-阅微基因

技术优势
■ 数据覆盖面广:可同时检出转录组及lncRNA信息,鉴定mRNA和低丰度的lncRNA
■ 数据得率高:高效的rRNA去除方法,保证lncRNA有效数据占比达到90%(即不超过10%的rRNA数据)
■ 信息分析全面:在获得测序数据后,可进行常规分析,联合分析及个性化分析,致力与提供最优质全面的分析服务内容。

测序策略
长链非编码RNA(lncRNA)测序-测序策略-阅微基因

收样要求
长链非编码RNA(lncRNA)测序-收样要求-阅微基因

生信分析流程
小RNA(small RNA)测序-生信分析流程-阅微基因


小RNA(small RNA)测序

小RNA 是存在于生物体内的一类高度保守的RNAs,序列的长度一般在18-32nt 之间,小RNA 包括了微小RNA(microRNA, miRNA),小干扰RNA(siRNA),核仁小RNA(snoRNA)和能与piwi 蛋白互作的piRNA 等。它们是各类生物生命活动中重要的调控因子,其作用与功能被研究的较为透彻,小RNA 们可参与基因的表达调控、转录后调控、RNA 的加工与剪切,疾病发生发展及个体发育调控等重要的生物学过程。小RNA 的测序采用高通量技术及胶分离技术,对于样本中所有特定长度的小RNA 片段进行测序和表达定量,一次性可以获得数百万条小RNA 的序列信息。并依托后续强大的生物信息分析平台,可以实现小RNA 的各类信息分析,鉴定已知或探索未知小RNA 与其靶作用基因以及解析各类小RNA 之间或与mRNA 的互作关系等。

技术路线
小RNA(small RNA)测序-技术路线-阅微基因

技术优势
检测结果全:可一次性得到上百万条的小RNA序列信息,包括已知的小RNA和未知小RNA,提供极大的数据深度和覆盖率。
分辨率高:可以从单碱基水平上对小RNA进行研究,便于分辨序列相似的小RNA且可以避免由芯片法带来的背景噪音。
任意物种检测:基于高通量测序平台,无需预先知晓物种小RNA基因的序列信息和二级结构,可直接对其进行深入全面的分析。

测序策略
小RNA(small RNA)测序-测序策略-阅微基因

收样要求
小RNA(small RNA)测序-收样要求-阅微基因

生信分析流程
小RNA(small RNA)测序-生信分析流程-阅微基因


环状RNA(circRNA)测序

环状RNA(circRNA),是相对于其他非编码RNA 发现较晚的一类特殊的、环状的、不具备或少具备编码能力的RNA,其广泛的存在于真核细胞的转录组中。环状RNA 通常是在mRNA 前体的可变剪切过程中,由上游外显子的5’端与下游外显子的3’端进行反向剪切而形成的。大量内源的环状RNA 存在于高等动物当中,它们在物种中保守,对RNA 酶不敏感,通常呈现组织和发展时期的表达特异性。已知环状RNA 具备重要的调控功能,其中包括可以充当miRNA 的分子海绵(ceRNA)与mRNA 竞争结合miRNAs;调控转录剪切、其他类型RNA 以及蛋白质活性等。最新的研究显示环状RNA 在动脉粥状硬化血管疾病、神经退行性疾病和多种癌症等疾病中扮演重要的角色。环状RNA 已经成为了近年研究热点,有望成为疾病诊断的检测标志物和靶向治疗靶点,研究意义重大。

技术路线
环状RNA(circRNA)测序-技术路线-阅微基因

技术优势
■ 多物种适用性:包括人类,大鼠,小鼠及其他物种(需事先评估),对这些样品进行全面深入的测序分析
■ 强大的数据分析能力:由中科院生物信息分析团队支撑,在环状RNA后期数据分析的过程中体现出优势
■ 高分辨率:可提供高深度的测序以发现样本中低丰度和稀有的环状RNA

测序策略
环状RNA(circRNA)测序-测序策略-阅微基因

收样要求
环状RNA(circRNA)测序-收样要求-阅微基因

生信分析流程
环状RNA(circRNA)测序-生信分析流程-阅微基因

4000192196    产品咨询info@microread.com   CN | EN| 友情链接 | 联系我们

Copyright 2019 北京阅微基因技术股份有限公司京ICP备09053524号