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工业与应用

基因科技提升产业竞争力

种质资源数据库

种质资源是作物培育新品种的重要遗传资源,中国保存种质资源总量突破52万份,位居世界第二。种质资源鉴定是种质资源保护工程中的重要一环。阅微基因受托构建水稻种质资源基因库,为中国水稻新品种的培育,提供了重要的数据库支持。


水稻是最重要的粮食作物之一,水稻产业的发展直接关系着粮食安全,水稻的种质资源对于育种至关重要。我国的水稻资源数量庞大,阅微基于国标48个STR位点,借助毛细管电泳测序技术平台,建立10个混扩体系。从设计引物到开发混扩体系,由峰型判读至调整Panel&Bin,通过对48个位点逐一斟酌判型标准,构建出水稻种质资源库。

水稻SSR国标位点的毛细管电泳方法


工作流程及重要节点

参考品定义
提取方法定义
峰形判读与定义
基因分型范围摸索
混扩体系优化
数据统计
数据库搭建
比对软件开发


种质资源数据库开发流程

凭借水稻种质资源鉴定数据库的项目经验,公司可完成更多作物品种的资源库开发工作,如小麦、玉米、豆类、花生等。具体流程如下:

需求确认 >> 确定位点方案 >> 分型判读定义(和已知品种对比) >> 构建混扩体系 >> 优化组合 >> 批量检测

种质资源数据库检测流程

公司可接收作物样本送检,具体流程如下:

DNA 提取 >> PCR 扩增 >> 上机检测 >>STR 分型>>结果审核与比对

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