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常规免疫组库V(D)J测序

简介

免疫组库(Immune repertoire, IR)是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞总和。BCR-seq、TCR-seq是通过对BCR的重链和轻链、TCR的α链和β链进行测序,全面了解其基因重排、序列的丰度和克隆型情况等。TCR/BCR测序常用于研究不同T/B细胞克隆的频率丰度和相互间关系,从而揭示更深层次的T/B细胞免疫应答机制、免疫耐受原因,免疫调节形式和功能特异性。目前已经被广泛的应用在自身免疫疾病、感染性疾病、肿瘤、器官移植、免疫治疗、细胞治疗等领域中。

技术路线

服务内容

通常TCR只测β链,BCR只测重链,因为这是富含信息最多的链。其他链在有特殊需求的情况下也可进行测序。

应用领域

10x单细胞免疫组库V(D)J测序-应用领域-阅微基因

您可以得到的分析内容


服务优势

基于5’RACE的方法:5’RACE相较于多重扩增的方法,可以检测到更多的V-J pairing多样性,同时具有更低的偏好性和更高的准确性。
数字标签(UMI)绝对定量:在进行cDNA文库构建时引入UMI标签,可去除PCR扩增重复、排除PCR偏好性影响,对TCR/BCR克隆的丰度进行绝对定量。
完善的分析内容:完善详尽的分析内容,尽力满足您的需求。并可根据客户个性化需求定制分析内容。
贴心的售后服务:报告解读,数据传送,问题解答,随时待命。

客户常见问题

Q1:在进行免疫组库VDJ测序时,使用DNA和RNA样本的差别是什么?
在进行常规免疫组库测序时,文库扩增的模板既可以是DNA样本也可以是RNA,但是选用不同类型的核酸,对于测序结果是有影响,下表详细的列出了使用DNA或RNA作为模板时的优缺点比较:


常规免疫组库VDJ-客户常见问题1


Q2:免疫组库测序是否可以测到TCR/BCR的VDJ序列的全长?

TCR和BCR的V(D)J序列长度在400bp左右。在进行免疫组库测序时可以选择不同模式,如果要测到VDJ全长,需要使用PE250模式(双端测序250bp),但是这种方法对应成本较高。一般免疫组库的VDJ测序选择PE150模式(双端测序150bp),中间没有测到的部分多变区会利用算法补齐。已有多篇研究显示:利用算法补齐和直接测序全长的效果是高度一致的。

常规VDJ测序-阅微基因


Q3:5’RACE的方法与PCR多重扩增的方法相比各有何优缺点?

如下表所示:


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