
16S/18S/ITS扩增子测序
细菌的16S rDNA,真核微生物的ITS或18S rDNA序列既有结构与功能上的高度保守性,又有种属间高变性的特征,对其扩增后进行测序就被称为扩增子测序。扩增子测序是研究环境微生物群落结构组成、挖掘样品间微生物差异、研究其多样性的重要方法。
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16S/18S全长扩增子测序
16S/18S rDNA包含可变区和保守区,原核微生物的16S rDNA基因长度约为1500bp,真核微生物18S rDNA基因长度约为1500-2000bp。保守区在菌种间差异不大,可反映物种间的亲缘关系,高变区具有属或种的特异性,根据物种亲缘关系不同而有一定的差异。因此16S /18S rDNA成为了国际公认…
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宏基因组测序
宏基因组学(Metagenomics),又被称为微生物环境基因组学、元基因组学。其研究不要求对每种微生物进行分离、纯化和培养,而是以特定生物环境中总的微生物群落作为研究对象,提取全部DNA对其进行高通量测序、序列组装和基因注释,获得环境微生物基因信息的总和。以此可以分析微…
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