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微生物研究

16S/18S/ITS扩增子测序

细菌的16S rDNA,真核微生物的ITS或18S rDNA序列既有结构与功能上的高度保守性,又有种属间高变性的特征,对其扩增后进行测序就被称为扩增子测序。扩增子测序是研究环境微生物群落结构组成、挖掘样品间微生物差异、研究其多样性的重要方法。
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16S/18S全长扩增子测序

16S/18S rDNA包含可变区和保守区,原核微生物的16S rDNA基因长度约为1500bp,真核微生物18S rDNA基因长度约为1500-2000bp。保守区在菌种间差异不大,可反映物种间的亲缘关系,高变区具有属或种的特异性,根据物种亲缘关系不同而有一定的差异。因此16S /18S rDNA成为了国际公认…
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宏基因组测序

宏基因组学(Metagenomics),又被称为微生物环境基因组学、元基因组学。其研究不要求对每种微生物进行分离、纯化和培养,而是以特定生物环境中总的微生物群落作为研究对象,提取全部DNA对其进行高通量测序、序列组装和基因注释,获得环境微生物基因信息的总和。以此可以分析微…
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代谢组学研究

微生物&代谢组联合分析

微生物&代谢组联合分析

微生物组测序(主要指16S扩增子测序与宏基因组测序)可提供肠道细菌构成、基因丰度和功能性信息,而代谢组学是研究生物体中代谢产物变化的科学,常用研究方法包括了:LC/MS(液质联用),GC/MS(气质联用)和NMR(核磁共振)。近年来,随着微生物组学研究的不断发展和持续火热…
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荧光定量分析

mRNA/lncRNA荧光定量

mRNA存在于原核生物和真核生物的细胞质及真核细胞的某些细胞器中,携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA。信使RNA从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA)。它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序。mRNA的表达对于…
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miRNA荧光定量

MicroRNA(miRNA) 是一类长度约19-24nt的非编码单链RNA,通过碱基互补配对的方式与靶基因的3-UTR区部分或完全互补,剪切靶基因的转录产物或者抑制转录产物的翻译,从而起到转录后调控靶基因表达的作用。miRNA广泛存在于动物、植物、真菌及病毒的基因组中,调控生物体生长发育和…
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circRNA荧光定量

环状RNA(circRNA)是区别线性RNA的一类新型RNA,结构为环状,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,比线性RNA更为稳定,使其在作为新型临床诊断标记物的…
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菌种荧光定量

荧光定量PCR技术是通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时监控反应过程。随着 PCR 反应的进行,反应产物不断累积,荧光信号强度也等比例增加。如此一来便可通过荧光强度变化监测产物量的变化,结合相应的分析软件,可以得到荧光扩增曲线,计算样本间…
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单细胞研究

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